84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7733 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 100 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  73.27 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 102 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  63.27 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  53 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  52 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  56.25 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  56.67 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.69 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  56.32 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  50.55 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  44.32 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  50.55 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.74 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.55 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.65 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.69 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  52.87 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  43.75 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.75 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  44.09 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  48.86 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  45.1 
 
 		 179 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  47.56 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  55.17 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  55.17 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  47.73 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  45.65 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.75 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  48.42 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.59 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  45.88 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  45.88 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  47.13 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.71 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  41.86 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  44.19 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.02 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  35.42 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  46.43 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  42.53 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  64.52 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  40.23 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  37.35 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0978  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.83 
 
 		 848 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  36.49 
 
 		 1192 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.73 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0368  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 1193 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.21 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0016  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 1183 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0384233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.33 
 
 		 327 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 435 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.29 
 
 		 331 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.63 
 
 		 269 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 86 aa  40.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 557 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.05 
 
 		 1110 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28 
 
 		 1190 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3419  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32.43 
 
 		 1195 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 426 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 431 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0209  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 1183 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0211552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0084  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  27.5 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0376016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0192  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.78 
 
 		 1183 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.02232e-32 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1328  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.4 
 
 		 1184 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000692132 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.81 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  28.95 
 
 		 1212 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1395  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.43 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 507 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0560  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.43 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0639  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.43 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 507 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  34.44 
 
 		 340 aa  40  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.11 
 
 		 318 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 		 282 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>