284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7690 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  48.42 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  47.98 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  48.42 
 
 		 223 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  49.55 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  49.55 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  49.55 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  49.55 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  47.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  51.53 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  46.64 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  48.66 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  47.79 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  45.7 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  46.88 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  45.05 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  45.98 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  44.84 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  45.78 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  48.02 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  47.75 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  47.53 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  47.53 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  46.46 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  47.53 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  47.53 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  46.72 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  47.35 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  47.79 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  47.79 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  47.49 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  47.79 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  46.05 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  46.22 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  44.39 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  45.06 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  43.91 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  43.5 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  44.59 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33.33 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.88 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.18 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.18 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  35.27 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.02 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  30.49 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.48 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  29.29 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.8 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  26.36 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  29.52 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.39 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 192 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  31.98 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27.98 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  34.18 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  35.46 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  28.51 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  32.77 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  29.36 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  29.36 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  29.36 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  29.36 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  29.31 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  31.71 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  28.94 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  28.94 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  29.31 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  28.94 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  27.23 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  28.81 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  28.94 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>