45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7544 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  63.16 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  57.65 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  55.17 
 
 
92 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  53.09 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  53.09 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  48.84 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  47.73 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  42.53 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  42.05 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  41.77 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  44.3 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  39.29 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  45.57 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  37.65 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  39.78 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  41.18 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  39.71 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  37.36 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  41.86 
 
 
155 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  29.35 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  36.25 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  33.71 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  32.53 
 
 
96 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  35.87 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36.9 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  39.44 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  41.56 
 
 
99 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  37.93 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  38.75 
 
 
158 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  27.78 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  30.95 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  34.25 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  34.12 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  36.78 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>