More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7270 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  60.8 
 
 
193 aa  228  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  60.8 
 
 
193 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  60.8 
 
 
193 aa  228  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
196 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  46.84 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.45 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4162  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.74 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  41.3 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  41.77 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  41.25 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  43.04 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  43.04 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  43.04 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.22 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  34.35 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.33 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  40 
 
 
270 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  42.68 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  34.57 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  32.14 
 
 
359 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  32.22 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
241 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.85 
 
 
244 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
224 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  34.62 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
214 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.86 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
247 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  26.11 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.21 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  26.98 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  26.78 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  44.83 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.15 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
231 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.53 
 
 
227 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  47.17 
 
 
248 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
224 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 
230 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 
683 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
266 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  47.17 
 
 
248 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
258 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.66 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  31.25 
 
 
211 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  33.64 
 
 
176 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  36.7 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  24.21 
 
 
284 aa  58.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>