More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7218 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 412 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  71.84 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  71.84 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.66 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.12 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.44 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.87 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.25 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.06 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.06 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.06 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.91 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.62 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.58 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.06 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  21.54 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.61 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.6 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.12 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.03 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.03 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.73 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.03 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.03 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.4 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.29 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.03 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.19 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>