More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7189 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0735  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  52.59 
 
 
683 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.431182  normal  0.0765632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5969  putative phytochrome sensor protein  75.32 
 
 
663 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118543  normal  0.0102226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2486  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  59.08 
 
 
672 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.141183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1778  helix-turn-helix, Fis-type  58.88 
 
 
673 aa  727    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7189  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  100 
 
 
662 aa  1362    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000334896  normal  0.517977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5897  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  74.31 
 
 
669 aa  928    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5659  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.4 
 
 
663 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0309  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  79.81 
 
 
657 aa  1031    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1075  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.37 
 
 
687 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.990194  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5127  putative sigma-54-dependent transcriptional regulator, HTH Fis-type family  59.21 
 
 
654 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.53901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1840  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  53.11 
 
 
667 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3245  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  73.78 
 
 
680 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3234  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  52.02 
 
 
699 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0436708  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2092  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  58.95 
 
 
676 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000637573  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0285  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.34 
 
 
687 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6164  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  75.16 
 
 
666 aa  931    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5158  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  74.07 
 
 
680 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.493898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5123  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  73.78 
 
 
680 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0328449  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3427  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  52.74 
 
 
648 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.535868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1691  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.48 
 
 
667 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1790  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  53.52 
 
 
753 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000112297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0479  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.78 
 
 
712 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3641  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.47 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2160  sigma-54 activated regulatory protein  50.47 
 
 
724 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0800  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.47 
 
 
646 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.236546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0890  sigma-54 dependent transcriptional regulator  50.24 
 
 
646 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3388  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.24 
 
 
637 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4403  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.32 
 
 
628 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4979  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.24 
 
 
637 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219279  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1819  sigma-54 activated regulatory protein  49.77 
 
 
651 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2583  sigma-54 activated regulatory protein  48.67 
 
 
709 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0698  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.69 
 
 
637 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4922  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  50.95 
 
 
629 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5308  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.24 
 
 
634 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0711362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3538  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  47.87 
 
 
660 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0899  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.57 
 
 
632 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599128  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.57 
 
 
632 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.917083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1556  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  46.79 
 
 
657 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1000  helix-turn-helix, Fis-type  43.94 
 
 
661 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2813  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.55 
 
 
699 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.475478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2870  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.02 
 
 
676 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.52 
 
 
609 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.606989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4569  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.58 
 
 
638 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0932  sigma54 specific transcriptional regulator  42.63 
 
 
653 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.702555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2864  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.97 
 
 
651 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1963  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.29 
 
 
647 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1744  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.73 
 
 
652 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0785861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0343  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.13 
 
 
640 aa  465  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00036469  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5649  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.76 
 
 
653 aa  449  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2736  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.88 
 
 
662 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.419098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4584  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.9 
 
 
692 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5954  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.06 
 
 
677 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0983903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2469  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.42 
 
 
636 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2614  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 
682 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6490  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.25 
 
 
701 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519588  normal  0.249204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2439  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.74 
 
 
625 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2951  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.09 
 
 
639 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0236757  normal  0.346853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3467  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.46 
 
 
636 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3077  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.61 
 
 
682 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2301  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.64 
 
 
636 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3636  sigma54 specific transcriptional regulator  38.15 
 
 
616 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  39.24 
 
 
611 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3741  sigma-54 dependent transcriptional regulator  38.11 
 
 
617 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3145  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.24 
 
 
705 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.21 
 
 
627 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08020  Sigma54-dependent transcriptional activator  39.31 
 
 
631 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0902  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  37.26 
 
 
672 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0591  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.96 
 
 
671 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.495015  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1734  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  37.5 
 
 
682 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1736  helix-turn-helix, Fis-type  37.77 
 
 
617 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.590224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0598  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.78 
 
 
661 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3175  putative GAF sensor protein  36.59 
 
 
629 aa  389  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1088  transcriptional regulator  38.03 
 
 
640 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3129  transcription regulator protein  38.8 
 
 
637 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.869922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0367  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.43 
 
 
696 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0336  transcriptional activator of acetoin/glycerol metabolism  36.72 
 
 
684 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0270  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.88 
 
 
598 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0546  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.03 
 
 
725 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0585  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.67 
 
 
671 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4479  sigma-54 dependent transcriptional regulator  35.79 
 
 
616 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4988  sigma54 specific transcriptional regulator  37.21 
 
 
638 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5133  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.71 
 
 
584 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0596409  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3573  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.98 
 
 
591 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1039  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.53 
 
 
666 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2694  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.94 
 
 
637 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777971  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3771  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.88 
 
 
619 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0365  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.57 
 
 
633 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0633679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0251  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.18 
 
 
628 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000347396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0249  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.74 
 
 
626 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0253  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.81 
 
 
652 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000233378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6814  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.82 
 
 
630 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890865  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0250  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.57 
 
 
619 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206516 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2789  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.79 
 
 
668 aa  369  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1400  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 
629 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2338  sigma-54 factor, interaction region  34.8 
 
 
612 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00232257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0249  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.67 
 
 
652 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0885  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.5 
 
 
661 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0287148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0252  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.43 
 
 
652 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1863  sigma-54 dependent transcriptional regulator  36.72 
 
 
605 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1975  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.72 
 
 
614 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>