More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7089 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.78 
 
 
338 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.63 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.22 
 
 
492 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.75 
 
 
341 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.47 
 
 
506 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.16 
 
 
363 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.86 
 
 
492 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.28 
 
 
377 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  34.2 
 
 
317 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.02 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.26 
 
 
331 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.08 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.86 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  30.79 
 
 
365 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.55 
 
 
364 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.32 
 
 
363 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  30.5 
 
 
364 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.26 
 
 
364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  30.5 
 
 
364 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.74 
 
 
326 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.96 
 
 
323 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  30.03 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.97 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.97 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  30.56 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.48 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.48 
 
 
378 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.04 
 
 
354 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  30.27 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.28 
 
 
338 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.18 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.23 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.96 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  36.43 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.1 
 
 
341 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.89 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.86 
 
 
315 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.66 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.34 
 
 
331 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34.74 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  36.44 
 
 
321 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.31 
 
 
326 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.23 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.38 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.89 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  36.55 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.39 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.9 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.03 
 
 
355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 
355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.34 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.65 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.95 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.71 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.05 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.5 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.87 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.5 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.7 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.91 
 
 
344 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03920  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.08 
 
 
316 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  0.810492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  31.76 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04180  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.4 
 
 
316 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.38 
 
 
315 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.54 
 
 
353 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.82 
 
 
366 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.67 
 
 
316 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  33.1 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.09 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.55 
 
 
319 aa  112  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  31.47 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.2 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.41 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.68 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.48 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.21 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.89 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.94 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.89 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.12 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.88 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.88 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.88 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  32.74 
 
 
351 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.04 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.85 
 
 
353 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.95 
 
 
315 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.49 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.92 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.03 
 
 
327 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  34.43 
 
 
355 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.79 
 
 
323 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.24 
 
 
312 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.13 
 
 
360 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 
360 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.22 
 
 
325 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.52 
 
 
335 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.07 
 
 
356 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>