More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7033 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  47.4 
 
 
154 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  50.33 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  50.33 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  41.45 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.8 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  43.8 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
150 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40.31 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  37.7 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  37.3 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  35.66 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  38.4 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.88 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  33.57 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  33.8 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.58 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  38.02 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.59 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  34.13 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.23 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  30.71 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.06 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.11 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  30.28 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  33.06 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.43 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  33.59 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.67 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  34.71 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  33.62 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  34.13 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  26.87 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.67 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  32.58 
 
 
629 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  31.97 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 
625 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.06 
 
 
600 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 
629 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.87 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.83 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  32.06 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.92 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  26.24 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.67 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  30.16 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30.47 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  40.19 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  33.06 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 
613 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  28.99 
 
 
626 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  34.38 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  27.81 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  35.58 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  34.45 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  34.68 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  29.03 
 
 
269 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  31.09 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>