119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7011 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 
378 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 
378 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  85.45 
 
 
378 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 
378 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  85.71 
 
 
378 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 
378 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  85.71 
 
 
378 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  90.74 
 
 
378 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  81.48 
 
 
378 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  75.66 
 
 
378 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  75.66 
 
 
378 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  74.01 
 
 
398 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  72.75 
 
 
384 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  71.43 
 
 
378 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  58.99 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  58.99 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  55.56 
 
 
380 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  55.29 
 
 
380 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  38.48 
 
 
366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  35.68 
 
 
380 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  35.43 
 
 
380 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 
386 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 
382 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
381 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  27.49 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
376 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  26.91 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  25.32 
 
 
410 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.89 
 
 
375 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 
407 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.87 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.02 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  23.15 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  24.62 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  27.38 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  24.56 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  21.68 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.36 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.73 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.78 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.85 
 
 
386 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  23.1 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  21.13 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  19.51 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  23.74 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  20.43 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.43 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.97 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  22.88 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 
400 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  26.57 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  23.83 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.25 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  22.84 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  23.59 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.5 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  21.66 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.87 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.96 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  19.95 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  20.48 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.57 
 
 
385 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.29 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  20.2 
 
 
390 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  20.35 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  21.88 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.86 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  26.74 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.03 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.58 
 
 
397 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25.33 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.44 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  21.6 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  21.22 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  20.77 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  20.75 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.6 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.84 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  24.09 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  20.94 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  21.14 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  22.88 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  22.14 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  23.84 
 
 
384 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
643 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.11 
 
 
397 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  20.78 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  21.14 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  21.72 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>