More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7006 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  44.92 
 
 		 949 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  51.68 
 
 		 1035 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 958 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 		 942 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 962 aa  1924    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  38.14 
 
 		 936 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  44.46 
 
 		 958 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  44.06 
 
 		 947 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  38.69 
 
 		 852 aa  605  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.99 
 
 		 4318 aa  316  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.75 
 
 		 4336 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  40.04 
 
 		 1067 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  38.6 
 
 		 4342 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.03 
 
 		 4342 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.19 
 
 		 3231 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  37.68 
 
 		 4332 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.2 
 
 		 2791 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.52 
 
 		 4336 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.98 
 
 		 4317 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  37.38 
 
 		 1801 aa  308  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 1272 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.8 
 
 		 1656 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.63 
 
 		 4317 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.46 
 
 		 4317 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 586 aa  304  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.79 
 
 		 4317 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 593 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.97 
 
 		 3235 aa  300  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  37.13 
 
 		 1291 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  37.13 
 
 		 1283 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  38.58 
 
 		 2250 aa  297  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 611 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  37.19 
 
 		 1276 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.2 
 
 		 2997 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 725 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 725 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 1292 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.82 
 
 		 3208 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  40.12 
 
 		 1776 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 		 3099 aa  290  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 1323 aa  290  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 586 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 614 aa  288  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 608 aa  288  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.69 
 
 		 2762 aa  287  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.76 
 
 		 1789 aa  286  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.81 
 
 		 2820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 586 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 586 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.58 
 
 		 1474 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  33.72 
 
 		 573 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  33.72 
 
 		 576 aa  284  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.21 
 
 		 6889 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 576 aa  282  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 595 aa  281  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  34.1 
 
 		 585 aa  280  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.84 
 
 		 1779 aa  280  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 573 aa  280  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 563 aa  279  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  279  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 578 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 574 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 584 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.8 
 
 		 581 aa  278  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 602 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  32.08 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 592 aa  274  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 839 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 568 aa  274  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 991 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 597 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.37 
 
 		 546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 544 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 544 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 597 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 653 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 603 aa  267  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 579 aa  267  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  33.51 
 
 		 608 aa  265  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.43 
 
 		 6403 aa  265  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  40.09 
 
 		 622 aa  264  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  35.59 
 
 		 559 aa  264  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 609 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 544 aa  263  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  36.45 
 
 		 610 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  36.45 
 
 		 599 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 599 aa  261  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 599 aa  261  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 599 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  36.45 
 
 		 610 aa  261  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 563 aa  260  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 580 aa  260  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>