More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6863 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6863  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00150835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1422  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.14 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00291687  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4835  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
261 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0350204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4127  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
258 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.61 
 
 
260 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  31.25 
 
 
339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1041  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.032518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.49 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.74 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.57 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.57 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.44 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.1 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.38 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.27 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.86 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.86 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.96 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.36 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.03 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  26.85 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.03 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.03 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.03 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.44 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.62 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.66 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.62 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.52 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.38 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.34 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.67 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.67 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.67 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.45 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.12 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.52 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.49 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.52 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.19 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.14 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.43 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.14 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.56 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.27 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.81 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.19 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.49 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.53 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.24 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.53 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.04 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.36 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.4 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.42 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.54 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  28 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.12 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.87 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.11 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.63 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.17 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.85 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.86 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.16 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.4 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.31 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.08 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.49 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3348  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.69 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.61 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  27 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>