More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6853 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 
459 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.06 
 
 
461 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  43.6 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 
473 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  43.26 
 
 
462 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.09 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.57 
 
 
468 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
460 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.61 
 
 
462 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.06 
 
 
474 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.13 
 
 
462 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
466 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  41.33 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  40.57 
 
 
477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  40.71 
 
 
450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
462 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  42.65 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  35.21 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  36.68 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.16 
 
 
459 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
452 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.54 
 
 
416 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.92 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
452 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  32.32 
 
 
459 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  32.32 
 
 
459 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  32.54 
 
 
452 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  32.54 
 
 
452 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  32.54 
 
 
452 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  32.54 
 
 
452 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  32.54 
 
 
452 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
459 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
463 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.86 
 
 
464 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.64 
 
 
474 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
459 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  31.76 
 
 
459 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  31.76 
 
 
459 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  32.08 
 
 
459 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.64 
 
 
474 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.17 
 
 
474 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
472 aa  189  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
488 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.07 
 
 
492 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.46 
 
 
473 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.35 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.57 
 
 
472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.18 
 
 
487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.08 
 
 
468 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  31.48 
 
 
472 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.42 
 
 
447 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.59 
 
 
473 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.36 
 
 
472 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.44 
 
 
479 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  30.79 
 
 
475 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.44 
 
 
479 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  30.79 
 
 
475 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  30.79 
 
 
472 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.02 
 
 
472 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.02 
 
 
472 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.02 
 
 
472 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.66 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
472 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
461 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  32.55 
 
 
467 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
494 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.25 
 
 
472 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
456 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  31.02 
 
 
472 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.67 
 
 
474 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
472 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
478 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
472 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
478 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  30.79 
 
 
472 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  30.65 
 
 
472 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.3 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  31.08 
 
 
474 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.14 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.94 
 
 
455 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.41 
 
 
455 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  30.75 
 
 
482 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.21 
 
 
477 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.41 
 
 
434 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>