More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6819 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  1001    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.46 
 
 
478 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
478 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
475 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  49.47 
 
 
480 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.89 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
477 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 
477 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.04 
 
 
477 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.68 
 
 
479 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.89 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
481 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  47.36 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.41 
 
 
481 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
476 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.41 
 
 
481 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
479 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 
477 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  48.83 
 
 
481 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  49.69 
 
 
477 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
480 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  48.62 
 
 
481 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.15 
 
 
476 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  47.99 
 
 
481 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  46.28 
 
 
477 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
495 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  48.62 
 
 
481 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
481 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.96 
 
 
478 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 
485 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.62 
 
 
481 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
476 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 
477 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
481 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 
477 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
477 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
477 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  47.57 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  46.92 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
478 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
477 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  48.52 
 
 
478 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
487 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.68 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  48.94 
 
 
478 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.35 
 
 
477 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
485 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
483 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.01 
 
 
476 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  43.61 
 
 
476 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
478 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.51 
 
 
489 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
489 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  41.61 
 
 
483 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.87 
 
 
483 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
483 aa  326  7e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.66 
 
 
483 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.66 
 
 
483 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.66 
 
 
483 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.66 
 
 
483 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.66 
 
 
483 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.66 
 
 
483 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.66 
 
 
483 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.45 
 
 
483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
488 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 
485 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.69 
 
 
483 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
479 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.99 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.99 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.99 
 
 
482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.99 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.34 
 
 
483 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 
482 aa  312  9e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
493 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
479 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.91 
 
 
483 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.12 
 
 
491 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.07 
 
 
486 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.99 
 
 
482 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.23 
 
 
480 aa  310  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
480 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  34.93 
 
 
484 aa  310  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.52 
 
 
485 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>