More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6806 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 383 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  80.16 
 
 		 383 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  78.59 
 
 		 383 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  76.24 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  65.8 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  65.8 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  65.8 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  60.97 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  62.8 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  61.62 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  61.89 
 
 		 360 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  61.73 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  61.73 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  61.99 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  61.73 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  44.36 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  45.32 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  44.13 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  44.13 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  44.13 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  44.12 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  44.12 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  44.15 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  44.41 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  43.85 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  44.41 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  43.64 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  43.5 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  40.26 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  41.22 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  40.92 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  39.62 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  38.59 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  36.85 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  36.01 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  38.38 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  36.41 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  38.64 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  34.75 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  31.77 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.82 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.82 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.95 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.67 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.79 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.79 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.84 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  31.42 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.94 
 
 		 367 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.96 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.98 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.14 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.14 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.38 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  30.61 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  30.91 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  31.14 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.96 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  29.18 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.16 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  30.84 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  31.34 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  29.52 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.75 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.76 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  32.69 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  31.9 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.59 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  31.83 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.3 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  29.14 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  32.36 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  29.33 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.69 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.69 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.69 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.65 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.69 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.69 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  32.69 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.69 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  30.89 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  30.89 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  30.89 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  28.85 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.62 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.62 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  30.3 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.71 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>