70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6730 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1131    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  49.64 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  50.28 
 
 		 562 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  32.48 
 
 		 1276 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  32.41 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1086 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  28.43 
 
 		 326 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  30.55 
 
 		 891 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.84 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  29.45 
 
 		 614 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  26.58 
 
 		 1141 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.34 
 
 		 803 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  25.29 
 
 		 453 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  29.18 
 
 		 534 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.53 
 
 		 873 aa  94  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  30.79 
 
 		 801 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  28.97 
 
 		 436 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  28.19 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  29.67 
 
 		 602 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  28.97 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  28.97 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  28.97 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  29.93 
 
 		 604 aa  87  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  28.91 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  27.35 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  24.5 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.93 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.93 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.32 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  24.46 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  28.4 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  25.58 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.74 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  24.35 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.3 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  25.07 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.33 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  24.85 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  27.19 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  25.5 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  23.62 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  23.32 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.05 
 
 		 600 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  23.72 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  25.37 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  24.32 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.36 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.29 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  22.44 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  24.59 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  22.76 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  24.02 
 
 		 392 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.39 
 
 		 544 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  24.04 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  21.94 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.26 
 
 		 654 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24.77 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  36 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1687  putative calcium binding protein  35.05 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  25.37 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  24 
 
 		 372 aa  43.9  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>