More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6695 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  100 
 
 
175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  69.18 
 
 
162 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
240 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
239 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
239 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
140 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  53.85 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
141 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  41.98 
 
 
172 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
174 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  50 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
230 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
169 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
169 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
170 aa  51.2  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.87 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  50 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  48.98 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  50 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.73 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
135 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
351 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  29.66 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  46.34 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  50 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  35.23 
 
 
258 aa  47.8  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  33.68 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  33.68 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
135 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
140 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  33.68 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  31 
 
 
189 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  43.64 
 
 
329 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  43.64 
 
 
329 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  42.19 
 
 
524 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  34.07 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  34.07 
 
 
141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  30.48 
 
 
120 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  32.29 
 
 
149 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
141 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  32.97 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  32.97 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  30.48 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  29.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  57.5 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  30.48 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  32.97 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  50 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  48 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
136 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>