More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6611 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  74.21 
 
 
479 aa  691  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  79.54 
 
 
479 aa  772  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  77.15 
 
 
479 aa  747  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  100 
 
 
479 aa  965  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  77.13 
 
 
479 aa  744  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 
477 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  54.41 
 
 
492 aa  506  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  53.16 
 
 
488 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  54.17 
 
 
475 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  52.85 
 
 
472 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  52.64 
 
 
472 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  52.85 
 
 
472 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  52.01 
 
 
472 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  52.85 
 
 
472 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  53.95 
 
 
487 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  52.73 
 
 
475 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  56.92 
 
 
494 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  53.28 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  52.32 
 
 
472 aa  466  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  52.11 
 
 
472 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  51.9 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  51.9 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  51.9 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  50.96 
 
 
469 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  47.18 
 
 
477 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  46.39 
 
 
471 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 
471 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  45.34 
 
 
472 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  45.63 
 
 
472 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  47.63 
 
 
465 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  52.43 
 
 
494 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
472 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  42.77 
 
 
472 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  46.81 
 
 
488 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  45.18 
 
 
482 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  45.53 
 
 
487 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  45.53 
 
 
487 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  44.61 
 
 
471 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  41.33 
 
 
466 aa  346  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  40.63 
 
 
473 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  41.63 
 
 
475 aa  339  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
458 aa  285  1e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
456 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.99 
 
 
448 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.79 
 
 
487 aa  255  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  33.7 
 
 
485 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  34.28 
 
 
485 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.56 
 
 
485 aa  253  4e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  33.86 
 
 
487 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  33.86 
 
 
487 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  33.86 
 
 
487 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
448 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.48 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.67 
 
 
462 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.23 
 
 
462 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.1 
 
 
450 aa  216  6e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
451 aa  216  6e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.32 
 
 
462 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  33.19 
 
 
477 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  33.48 
 
 
474 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.65 
 
 
467 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
459 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.07 
 
 
474 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.73666e-10  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
466 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
460 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
473 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.11 
 
 
468 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.57 
 
 
470 aa  202  1e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.56 
 
 
461 aa  202  1e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.01 
 
 
462 aa  199  8e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  1.09951e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
451 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
470 aa  191  3e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.87 
 
 
457 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  30 
 
 
468 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
459 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.56 
 
 
455 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.74 
 
 
459 aa  185  2e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.48 
 
 
455 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
462 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.2 
 
 
476 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
472 aa  175  1e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
461 aa  173  7e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.42 
 
 
478 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.06 
 
 
472 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.2 
 
 
478 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  29.15 
 
 
463 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.98 
 
 
478 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.98 
 
 
478 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.98 
 
 
478 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.86 
 
 
459 aa  170  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.11 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  25.6 
 
 
447 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.81 
 
 
460 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.76 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.76 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.14 
 
 
430 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.39 
 
 
474 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.67 
 
 
474 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
459 aa  166  7e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.81 
 
 
474 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>