More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6508 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  65.43 
 
 		 188 aa  248  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  49.7 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2495  cytochrome B561  49.7 
 
 		 191 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.512394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  43.18 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  43.18 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  43.18 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  41.48 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.91 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  40.34 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.38 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  39.11 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  40.68 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.34 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  39.18 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.88 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  39.31 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  35.26 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.12 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  39.88 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  43.18 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  34.74 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.95 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.73 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.73 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  37.1 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.82 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  38.55 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  40.98 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  40.36 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  39.02 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.15 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  32.75 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  37.58 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  30.43 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  32.43 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  36.52 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  33.83 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.93 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35 
 
 		 178 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.5 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  38.59 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.66 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.03 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.07 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.23 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  41.46 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  34.66 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.64 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  35.93 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.94 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  36.72 
 
 		 420 aa  89.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  34.83 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.15 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  40.85 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  40.85 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  37.78 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  40.85 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.79 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  40.61 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  40.61 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  39.88 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  31.25 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  35.39 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.66 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.52 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.64 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  34.91 
 
 		 406 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  39.64 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.64 
 
 		 175 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  38.04 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.48 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  33.33 
 
 		 400 aa  84.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  33.52 
 
 		 397 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  35.43 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  39.64 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  38.04 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  37.99 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.16 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  32.73 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  35.39 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  41.52 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  35.88 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.33 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  33.15 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.84 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  32.62 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.12 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.36 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  38.15 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  32.02 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  30.51 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>