More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6470 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
471 aa  950    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  72.15 
 
 
466 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  72.37 
 
 
466 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.97 
 
 
471 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.25 
 
 
461 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  72.37 
 
 
466 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  73.25 
 
 
460 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  73.68 
 
 
470 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  77.41 
 
 
469 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.27 
 
 
459 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  72.15 
 
 
466 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.5 
 
 
486 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.25 
 
 
480 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.49 
 
 
459 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  72.15 
 
 
466 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  72.15 
 
 
466 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.25 
 
 
480 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.03 
 
 
459 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  72.15 
 
 
466 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.02 
 
 
456 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  53.44 
 
 
481 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  54.29 
 
 
488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.29 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  52.8 
 
 
456 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  52.68 
 
 
487 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.99 
 
 
478 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 
477 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  48.69 
 
 
501 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  47.72 
 
 
458 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
449 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  48.62 
 
 
467 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  45.96 
 
 
470 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  39.66 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
461 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  39.96 
 
 
459 aa  320  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
474 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
485 aa  316  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  38.57 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
483 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
464 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  39.31 
 
 
456 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
451 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  34.34 
 
 
467 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  32.68 
 
 
469 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  41.28 
 
 
287 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
564 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.91 
 
 
564 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  40.17 
 
 
387 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  41.26 
 
 
447 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
695 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  36.17 
 
 
482 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  41.34 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.52 
 
 
557 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  28.34 
 
 
553 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.58 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  33.07 
 
 
643 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
563 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  31.78 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  34.87 
 
 
525 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  27.56 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  35 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
359 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  41.47 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  37.55 
 
 
381 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  37.55 
 
 
381 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
468 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
771 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
700 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
574 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  29.18 
 
 
553 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
381 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.63 
 
 
640 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.13 
 
 
515 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  37.07 
 
 
783 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
640 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  35.29 
 
 
645 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  34.33 
 
 
391 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  30.65 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  32.31 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
563 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 
567 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  36.16 
 
 
772 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
1229 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
561 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
603 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.29 
 
 
683 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  34.8 
 
 
392 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
535 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
394 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.61 
 
 
1101 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  34.02 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>