236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6460 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 471 aa  977    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  43.11 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  34.14 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  30.58 
 
 		 435 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  29.39 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.92 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.79 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  30.63 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  28.95 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 		 487 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  28.99 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  29.03 
 
 		 469 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  25.44 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  26.41 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  26.12 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  27.23 
 
 		 506 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  26.67 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  26.75 
 
 		 506 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  26.46 
 
 		 505 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  24.87 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  25.8 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  26.02 
 
 		 499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  30.17 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  25.11 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  24.82 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  24.46 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  24.73 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.11 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.16 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  24.03 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.32 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  25.49 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  24.94 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  26.33 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  23.86 
 
 		 528 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  23.74 
 
 		 507 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  24.32 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  26.67 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  26.42 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 457 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  25.58 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  24.04 
 
 		 451 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  22.92 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  25.7 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  25.93 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  25.93 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  26.68 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  26.68 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  25.71 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.06 
 
 		 455 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  26.83 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  23.76 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  25.93 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  25.45 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  25.05 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.12 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  25.05 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  25.05 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  25.45 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  24.46 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  22.81 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  25.38 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  24.42 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  23.67 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  26.15 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  24.78 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  26.39 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  24.31 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  26.26 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  22.71 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  22.52 
 
 		 446 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  24.16 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  24.01 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  25.72 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  25.9 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  23.37 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  24.8 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  23.15 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  22.45 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  24.75 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  25.32 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  24.27 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  24.7 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  23.92 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  24.88 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  23.9 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  25.27 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  24.86 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  23.85 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  24.84 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  24.71 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>