More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6422 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
263 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  77.19 
 
 
257 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  68.06 
 
 
263 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  68.44 
 
 
258 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  71.6 
 
 
257 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.45 
 
 
263 aa  358  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.06 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  70.2 
 
 
258 aa  352  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  66.94 
 
 
262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.79 
 
 
263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  66.94 
 
 
262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  62.36 
 
 
262 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.21 
 
 
263 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.94 
 
 
262 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.94 
 
 
262 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.8 
 
 
263 aa  347  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  67.2 
 
 
263 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.39 
 
 
263 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.39 
 
 
263 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.39 
 
 
263 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.82 
 
 
262 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.12 
 
 
262 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.98 
 
 
263 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.98 
 
 
263 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  65.98 
 
 
263 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  65.49 
 
 
263 aa  341  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  65.1 
 
 
263 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  63.67 
 
 
263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.86 
 
 
262 aa  329  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  61.73 
 
 
259 aa  328  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  59.26 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  59.09 
 
 
259 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  56.61 
 
 
259 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  57.66 
 
 
258 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  58.68 
 
 
258 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  55.97 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  53.06 
 
 
260 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.51 
 
 
261 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 
249 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  56.96 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  56.78 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.85 
 
 
256 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  53.14 
 
 
255 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.37 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  57.21 
 
 
255 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  57.21 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  56.54 
 
 
215 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  50.63 
 
 
241 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  47.39 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  51.43 
 
 
241 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.55 
 
 
256 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.99 
 
 
234 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.8 
 
 
262 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.8 
 
 
262 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.17 
 
 
240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.89 
 
 
258 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  34.44 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  34.8 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  33.6 
 
 
262 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  34.35 
 
 
234 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.35 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.96 
 
 
249 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.38 
 
 
234 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.06 
 
 
256 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.54 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 
247 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.7 
 
 
319 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 
247 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.92 
 
 
233 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.68 
 
 
266 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
253 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  38.04 
 
 
315 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  36.75 
 
 
318 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.04 
 
 
315 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.18 
 
 
229 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.09 
 
 
501 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.84 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.46 
 
 
199 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  26.16 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.46 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 
332 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.05 
 
 
495 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.8 
 
 
200 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.05 
 
 
200 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 
374 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.52 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.65 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.45 
 
 
332 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.11 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.86 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.82 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>