69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6419 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  68.54 
 
 
638 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  68.85 
 
 
644 aa  885    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  68.59 
 
 
640 aa  907    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  68.68 
 
 
644 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  70.47 
 
 
640 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  69.84 
 
 
641 aa  916    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  69.4 
 
 
644 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  68.54 
 
 
638 aa  877    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  72.7 
 
 
638 aa  972    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  71.97 
 
 
641 aa  922    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  72.87 
 
 
630 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  69.57 
 
 
644 aa  886    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  72.87 
 
 
630 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  71.97 
 
 
641 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  68.54 
 
 
638 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  70.72 
 
 
523 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  72.7 
 
 
638 aa  974    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  68.38 
 
 
638 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  71.97 
 
 
641 aa  922    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  71.91 
 
 
647 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  73.01 
 
 
713 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  68.22 
 
 
638 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  66.83 
 
 
660 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  71.97 
 
 
650 aa  923    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  68.54 
 
 
638 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  72.7 
 
 
638 aa  972    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  70.03 
 
 
643 aa  921    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  77.07 
 
 
638 aa  1033    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  71.97 
 
 
650 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  72.85 
 
 
638 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  68.22 
 
 
638 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  69.22 
 
 
640 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  68.84 
 
 
644 aa  895    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  73.16 
 
 
645 aa  927    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  73.48 
 
 
711 aa  978    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1305    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  68.91 
 
 
640 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  68.84 
 
 
644 aa  903    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  79.41 
 
 
638 aa  1058    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  69.84 
 
 
641 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  69.69 
 
 
641 aa  915    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  30.17 
 
 
743 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  30.24 
 
 
708 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  28.29 
 
 
729 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  29.22 
 
 
663 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  27.19 
 
 
727 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  26.93 
 
 
718 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  26.93 
 
 
775 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  26.93 
 
 
722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  25.82 
 
 
761 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  25.91 
 
 
733 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  25.49 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  25.71 
 
 
808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.41 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  24.5 
 
 
738 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  24.5 
 
 
738 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  24.37 
 
 
738 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  24.6 
 
 
738 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  26.01 
 
 
669 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  26.01 
 
 
669 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  26.01 
 
 
669 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  26.01 
 
 
722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  24.97 
 
 
730 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  24.77 
 
 
738 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  24.74 
 
 
738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.83 
 
 
668 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.5 
 
 
1026 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  22.65 
 
 
1259 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  29.32 
 
 
1314 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>