More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6305 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  100 
 
 		 955 aa  1924    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  38 
 
 		 891 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  42.13 
 
 		 475 aa  318  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  42.41 
 
 		 460 aa  312  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  38.85 
 
 		 462 aa  307  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  41.16 
 
 		 467 aa  303  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  38.53 
 
 		 475 aa  302  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  42.21 
 
 		 468 aa  301  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  35.9 
 
 		 460 aa  295  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  42.04 
 
 		 463 aa  293  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  28.7 
 
 		 959 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  28.75 
 
 		 956 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  39.86 
 
 		 411 aa  272  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  38.52 
 
 		 411 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  40.05 
 
 		 457 aa  266  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.85 
 
 		 472 aa  262  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  42.54 
 
 		 463 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.56 
 
 		 429 aa  259  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.31 
 
 		 429 aa  258  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.31 
 
 		 429 aa  258  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.31 
 
 		 429 aa  258  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.31 
 
 		 459 aa  258  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.31 
 
 		 468 aa  257  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.31 
 
 		 459 aa  258  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.06 
 
 		 429 aa  255  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 459 aa  255  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 463 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 459 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 459 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 459 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.5 
 
 		 477 aa  253  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 459 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  41 
 
 		 463 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.1 
 
 		 477 aa  251  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  40.17 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  35.87 
 
 		 459 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.29 
 
 		 472 aa  248  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  35.42 
 
 		 458 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.76 
 
 		 459 aa  246  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  39.3 
 
 		 453 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  36.99 
 
 		 463 aa  243  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  38.26 
 
 		 845 aa  241  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  36.89 
 
 		 477 aa  240  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  36.28 
 
 		 463 aa  240  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  32.54 
 
 		 462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  30.23 
 
 		 957 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.04 
 
 		 457 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  35.39 
 
 		 449 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.46 
 
 		 393 aa  233  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  42.33 
 
 		 453 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3241  aminotransferase class-III  33.89 
 
 		 455 aa  230  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  37.67 
 
 		 477 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.62 
 
 		 375 aa  227  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  35.94 
 
 		 457 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  36.87 
 
 		 403 aa  221  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.98 
 
 		 394 aa  221  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  34.62 
 
 		 386 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  34.91 
 
 		 386 aa  219  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.38 
 
 		 446 aa  217  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  34.6 
 
 		 386 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  34.1 
 
 		 395 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  32.76 
 
 		 398 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  35.14 
 
 		 469 aa  214  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  33.56 
 
 		 451 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  36.17 
 
 		 407 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  32.62 
 
 		 402 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  40.59 
 
 		 399 aa  213  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  33.66 
 
 		 396 aa  211  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  33.66 
 
 		 396 aa  211  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  36.19 
 
 		 406 aa  211  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 402 aa  211  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.76 
 
 		 397 aa  211  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  35.82 
 
 		 402 aa  210  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  33.73 
 
 		 403 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  34.67 
 
 		 399 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  35.8 
 
 		 403 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  33.73 
 
 		 403 aa  209  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  33.66 
 
 		 399 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  34.6 
 
 		 386 aa  208  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 395 aa  208  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  34.85 
 
 		 386 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  33.92 
 
 		 403 aa  208  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.44 
 
 		 397 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  34.34 
 
 		 386 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  34.34 
 
 		 386 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 394 aa  207  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  35.11 
 
 		 386 aa  207  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  32.43 
 
 		 396 aa  207  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  35.8 
 
 		 385 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  35.81 
 
 		 386 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 		 391 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  40.18 
 
 		 396 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.71 
 
 		 413 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  36.08 
 
 		 405 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  35.66 
 
 		 403 aa  206  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  34.35 
 
 		 403 aa  206  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  36.61 
 
 		 415 aa  206  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  35.93 
 
 		 399 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  33.67 
 
 		 426 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.74 
 
 		 394 aa  205  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>