123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6251 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  45.3 
 
 
788 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  76.93 
 
 
789 aa  1162    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  100 
 
 
789 aa  1585    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  70.72 
 
 
789 aa  1159    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  44.33 
 
 
788 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  44.6 
 
 
787 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  43.95 
 
 
787 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  43.53 
 
 
787 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  44.54 
 
 
787 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  70.72 
 
 
789 aa  1159    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  44.22 
 
 
787 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  41.96 
 
 
787 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  41.68 
 
 
787 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.5 
 
 
793 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  43.76 
 
 
793 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  42.23 
 
 
789 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  37.96 
 
 
788 aa  565  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  39.62 
 
 
787 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.23 
 
 
786 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  39.29 
 
 
787 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  39.42 
 
 
788 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  38.75 
 
 
787 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  40.7 
 
 
787 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  38.8 
 
 
791 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.62 
 
 
790 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  37.77 
 
 
800 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  43.03 
 
 
786 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  38.15 
 
 
787 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.87 
 
 
787 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
786 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  38.69 
 
 
788 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  40.75 
 
 
786 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  40.63 
 
 
786 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  37.87 
 
 
787 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  36.91 
 
 
793 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.84 
 
 
790 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  37.02 
 
 
789 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.54 
 
 
792 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.74 
 
 
791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
792 aa  330  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
792 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
797 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.06 
 
 
787 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 
774 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.92 
 
 
947 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.81 
 
 
1090 aa  140  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 
1177 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.86 
 
 
773 aa  134  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.22 
 
 
1132 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.04 
 
 
1132 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 
1016 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.97 
 
 
1232 aa  104  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.04 
 
 
859 aa  97.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.23 
 
 
868 aa  95.9  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 
737 aa  95.9  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 
917 aa  95.9  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.48 
 
 
876 aa  87.4  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  19.97 
 
 
1143 aa  87.4  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 
743 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  17.5 
 
 
1068 aa  86.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  25.95 
 
 
806 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 
1110 aa  79.7  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  23.12 
 
 
876 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.82 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.48 
 
 
749 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  20.83 
 
 
759 aa  68.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.25 
 
 
395 aa  63.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 
852 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
378 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  26.79 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 
834 aa  51.2  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  22.17 
 
 
821 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
375 aa  51.2  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  23.08 
 
 
384 aa  50.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1229  hypothetical protein  20.5 
 
 
409 aa  50.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.965608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.92 
 
 
404 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
857 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.74 
 
 
406 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 
837 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
413 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.19 
 
 
389 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  26.04 
 
 
847 aa  48.9  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 
413 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.04 
 
 
389 aa  48.9  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.87 
 
 
408 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 
409 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 
838 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29.58 
 
 
832 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  20.47 
 
 
412 aa  47.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
404 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.28 
 
 
421 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  27.5 
 
 
827 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.41 
 
 
434 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.58 
 
 
858 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
856 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
842 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.8 
 
 
858 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  26.79 
 
 
406 aa  46.6  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.18 
 
 
417 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>