More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6245 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  75.52 
 
 
286 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  69.97 
 
 
293 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  70.57 
 
 
287 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  65.73 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  66.32 
 
 
291 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  60.07 
 
 
285 aa  361  8e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  61.97 
 
 
300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  49.65 
 
 
286 aa  275  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.12 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  30.63 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
272 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  28.52 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30.24 
 
 
291 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 
277 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  28.11 
 
 
271 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 
307 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  29.56 
 
 
258 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 
280 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  24.2 
 
 
258 aa  99.4  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  31.32 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.6 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.08 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.11 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.11 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  30.66 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  29.67 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  26.71 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 
278 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  29.26 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 
610 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  29.17 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  31.01 
 
 
289 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  31.84 
 
 
284 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
321 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  27.41 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  28.73 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.62 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  27.96 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 
289 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  30.74 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.98 
 
 
613 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
289 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  26.71 
 
 
269 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.98 
 
 
270 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  30.2 
 
 
288 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  30 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  28.51 
 
 
277 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1149  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 
457 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.17 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.51 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  29.51 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  30.89 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.54 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1308  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.82 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  27.6 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  27.4 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.03 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  27.78 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.2 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  25.98 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  27.78 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  27.78 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.74 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.6 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  31.84 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  25.67 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  27.92 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 
325 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  28.14 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.8 
 
 
277 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.35 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  27.6 
 
 
269 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  28.92 
 
 
306 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>