More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6226 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  100 
 
 
509 aa  1050    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  79.25 
 
 
508 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  77.71 
 
 
509 aa  786    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  77.06 
 
 
508 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  79.45 
 
 
508 aa  834    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  61.23 
 
 
513 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  55.11 
 
 
509 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  49.9 
 
 
496 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  47.59 
 
 
506 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
512 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  47.87 
 
 
508 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
527 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.39 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  46.64 
 
 
501 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
486 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  41.53 
 
 
490 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
489 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.42 
 
 
494 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 
488 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
495 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 
491 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  39.71 
 
 
488 aa  345  8.999999999999999e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
499 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
495 aa  336  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 
491 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
497 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.94 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
473 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.38 
 
 
485 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
494 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.42 
 
 
494 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.91 
 
 
504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 
464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  31.49 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  33.54 
 
 
509 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.18 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
504 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.46 
 
 
499 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  34.44 
 
 
495 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
490 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.72 
 
 
488 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 
463 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.74 
 
 
515 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.28 
 
 
508 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  32.72 
 
 
489 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.12 
 
 
464 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  28.39 
 
 
463 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
520 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
485 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.92 
 
 
495 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
504 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.66 
 
 
499 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.54 
 
 
488 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  32.33 
 
 
475 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  29.96 
 
 
495 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
473 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.05 
 
 
478 aa  203  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
492 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
503 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.64 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  31.4 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.11 
 
 
496 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.27 
 
 
497 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
493 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
490 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
496 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
493 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.43 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  31 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  32.72 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
506 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
506 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  30.68 
 
 
511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 
471 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
488 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
513 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
574 aa  196  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.65 
 
 
517 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
492 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.25 
 
 
503 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
492 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  29.94 
 
 
501 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.54 
 
 
509 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  37.72 
 
 
570 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  37.72 
 
 
493 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  30.38 
 
 
521 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 
471 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.92 
 
 
514 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>