40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6142 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  43.12 
 
 
445 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  36.3 
 
 
438 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  35.29 
 
 
438 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  40.48 
 
 
370 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  37.58 
 
 
366 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  34.06 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  38.84 
 
 
340 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  38.84 
 
 
340 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  34.93 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  34.15 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  32.87 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  39.84 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  35.66 
 
 
357 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  29.57 
 
 
356 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  29.37 
 
 
348 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  29.01 
 
 
330 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  32.52 
 
 
335 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  29.93 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  28.24 
 
 
330 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  28.12 
 
 
337 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  30.3 
 
 
356 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.33 
 
 
338 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 
949 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
825 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 
862 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  34.38 
 
 
872 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
880 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
877 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
880 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
880 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 
880 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  31.58 
 
 
880 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 
976 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>