161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6108 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  32.17 
 
 		 1211 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  71.22 
 
 		 1329 aa  1857    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  43.47 
 
 		 1302 aa  1083    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  43.5 
 
 		 1302 aa  1081    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  71.47 
 
 		 1366 aa  1863    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  52.66 
 
 		 1317 aa  1295    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  45.77 
 
 		 1289 aa  1050    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  46.27 
 
 		 1302 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  68.73 
 
 		 1358 aa  1722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  72.77 
 
 		 1369 aa  1962    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  55.35 
 
 		 1332 aa  1364    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  47.32 
 
 		 1268 aa  1171    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  46.38 
 
 		 1302 aa  1110    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  45.7 
 
 		 1289 aa  1048    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  73.86 
 
 		 1365 aa  1956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  45.77 
 
 		 1289 aa  1051    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  72.69 
 
 		 1365 aa  1955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  65.45 
 
 		 890 aa  974    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  73.65 
 
 		 431 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1348 aa  2747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  65.45 
 
 		 890 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  73.65 
 
 		 431 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  45.7 
 
 		 1289 aa  1045    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  46.34 
 
 		 1302 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  68.66 
 
 		 1358 aa  1722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  46.34 
 
 		 1302 aa  1137    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  68.58 
 
 		 1358 aa  1722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1205 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1208 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 1209 aa  613  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  33.46 
 
 		 1209 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  33.23 
 
 		 1209 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  33.23 
 
 		 1209 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  33.23 
 
 		 1209 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  33.23 
 
 		 1209 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  33.23 
 
 		 1209 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  33.23 
 
 		 1209 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  33.08 
 
 		 1209 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.52 
 
 		 1199 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  29.42 
 
 		 1275 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1275 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  31.75 
 
 		 1218 aa  538  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  32.18 
 
 		 1220 aa  532  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  28.72 
 
 		 1212 aa  512  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  29.07 
 
 		 1150 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  29.21 
 
 		 1171 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1176 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  29.19 
 
 		 1207 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1102 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.9 
 
 		 1172 aa  413  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1181 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.35 
 
 		 1182 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  26.24 
 
 		 1181 aa  352  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1173 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  27.94 
 
 		 1176 aa  347  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  29.92 
 
 		 1204 aa  341  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.52 
 
 		 1164 aa  338  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.42 
 
 		 1173 aa  338  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.72 
 
 		 1148 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1164 aa  297  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  24.26 
 
 		 1164 aa  297  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  23.8 
 
 		 1187 aa  268  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.9 
 
 		 1157 aa  265  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.87 
 
 		 1152 aa  265  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  28.38 
 
 		 1175 aa  264  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1192 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1168 aa  257  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1179 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.05 
 
 		 1182 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1208 aa  244  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  24 
 
 		 1206 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.14 
 
 		 1206 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  24.28 
 
 		 1179 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  24.31 
 
 		 1194 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1175 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1175 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1008 aa  213  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 1194 aa  213  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1147 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1167 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1167 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1167 aa  211  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1167 aa  211  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1104 aa  211  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  26.68 
 
 		 728 aa  208  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  26.76 
 
 		 1164 aa  206  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  23.25 
 
 		 1165 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  24.23 
 
 		 1205 aa  197  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 1177 aa  197  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23.4 
 
 		 1177 aa  197  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.29 
 
 		 1288 aa  191  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  21.81 
 
 		 1165 aa  172  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.2 
 
 		 1165 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1270 aa  159  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.68 
 
 		 1230 aa  159  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1174 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1174 aa  149  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  23.45 
 
 		 1153 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1129 aa  145  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  27.1 
 
 		 830 aa  144  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>