More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6042 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  82.18 
 
 
449 aa  754    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  70.59 
 
 
439 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  76.6 
 
 
435 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  82.14 
 
 
446 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
459 aa  940    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  82.18 
 
 
449 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  73.07 
 
 
448 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  75.06 
 
 
439 aa  673    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  75.33 
 
 
450 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  79.59 
 
 
440 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  79.04 
 
 
470 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  76.21 
 
 
450 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  69.82 
 
 
439 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.09 
 
 
448 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  79.43 
 
 
441 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  72.83 
 
 
439 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  71.98 
 
 
419 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  69.45 
 
 
419 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  67.7 
 
 
423 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  70.73 
 
 
427 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  65.94 
 
 
425 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  64.89 
 
 
436 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  64.95 
 
 
417 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  62.65 
 
 
416 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
422 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
445 aa  289  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  40.59 
 
 
434 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.5 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  37.7 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
430 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  38.63 
 
 
446 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
419 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
430 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
428 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
427 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  38.54 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.39 
 
 
435 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 
443 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
399 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  34.53 
 
 
433 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  35.31 
 
 
423 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  34.76 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  37.25 
 
 
433 aa  253  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  39.75 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
429 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  35.84 
 
 
415 aa  246  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 
348 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.81 
 
 
466 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  29.7 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  29.7 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.61 
 
 
377 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  36.7 
 
 
343 aa  140  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.09 
 
 
361 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.46 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.86 
 
 
372 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.33 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  35.59 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  35.59 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.36 
 
 
413 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  36.16 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 
378 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  34.68 
 
 
344 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  34.53 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  35.14 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  33.78 
 
 
347 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.6 
 
 
360 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  27.99 
 
 
352 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 
381 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.89 
 
 
399 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
362 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.2 
 
 
369 aa  103  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  32.99 
 
 
640 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.14 
 
 
362 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  33.49 
 
 
371 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.66 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
348 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  38.51 
 
 
401 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
358 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  33.33 
 
 
364 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  35.52 
 
 
396 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  37.63 
 
 
407 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  32.65 
 
 
378 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  32.18 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.21 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.82 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  30.48 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.17 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  31.15 
 
 
607 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  30.29 
 
 
357 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.49 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  28.87 
 
 
598 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  26.44 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>