244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5906 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  84.62 
 
 
196 aa  343  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  83.59 
 
 
196 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  73.85 
 
 
213 aa  296  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  71.79 
 
 
210 aa  285  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.9 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  45.6 
 
 
219 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.97 
 
 
223 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.88 
 
 
203 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  40.41 
 
 
220 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  40.93 
 
 
220 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  39.2 
 
 
216 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.65 
 
 
217 aa  154  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  40.31 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.27 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  39.7 
 
 
202 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  39.41 
 
 
202 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  37.44 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  40.4 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  43.94 
 
 
231 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  35.03 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  39.9 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  43.85 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  35.98 
 
 
203 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  41.71 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  41.71 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  35.48 
 
 
204 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.14 
 
 
203 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.68 
 
 
209 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.98 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.68 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33.33 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  33.33 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.23 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  32.34 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  35.6 
 
 
196 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  32.84 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.9 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  32.16 
 
 
201 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  35.59 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.41 
 
 
295 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  31.66 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.99 
 
 
199 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  30.57 
 
 
209 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.15 
 
 
219 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.21 
 
 
216 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  38.61 
 
 
207 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.64 
 
 
294 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  34.03 
 
 
208 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  31.05 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  32.57 
 
 
292 aa  98.2  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.87 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  29.26 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  35.22 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  32.64 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  34.46 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  33.77 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  33.77 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  35.71 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  32.8 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  33.12 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  35.53 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  33.99 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.98 
 
 
294 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  32.28 
 
 
205 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  32.34 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.34 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  33.8 
 
 
169 aa  91.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  32.26 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  33.12 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  28.4 
 
 
291 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  32.02 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.47 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  35.57 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  34.42 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  34.42 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  33.55 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  31.03 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.55 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  30.43 
 
 
200 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  28.19 
 
 
218 aa  89  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  33.99 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  29.26 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  29.19 
 
 
229 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>