57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5604 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  55.52 
 
 		 659 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  86.13 
 
 		 761 aa  1046    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  100 
 
 		 772 aa  1561    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  84.59 
 
 		 748 aa  1211    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  56.03 
 
 		 658 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  53.99 
 
 		 640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  40.23 
 
 		 763 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  40.16 
 
 		 760 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  38.9 
 
 		 743 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  54.69 
 
 		 1281 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.23 
 
 		 1276 aa  61.6  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  43.43 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1086 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  48.15 
 
 		 667 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.42 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.85 
 
 		 830 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 		 846 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.15 
 
 		 771 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 		 257 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  52.63 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  36.67 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 778 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  52.46 
 
 		 628 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  48.21 
 
 		 916 aa  48.5  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 914 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 570 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  65.12 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  51.85 
 
 		 253 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  38.27 
 
 		 682 aa  47.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  54.55 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  44.64 
 
 		 457 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  34.83 
 
 		 268 aa  47  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  63.16 
 
 		 431 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  63.16 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1279 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  49.12 
 
 		 555 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  56 
 
 		 673 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  43.04 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  44.07 
 
 		 1409 aa  46.2  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.71 
 
 		 2313 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  52.38 
 
 		 1110 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  38.1 
 
 		 436 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 		 444 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  46.81 
 
 		 488 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  36.71 
 
 		 840 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  45.83 
 
 		 243 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  50.79 
 
 		 671 aa  45.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  28.78 
 
 		 586 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  42.11 
 
 		 876 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  30 
 
 		 530 aa  44.3  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.61 
 
 		 445 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.63 
 
 		 774 aa  44.3  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  34.23 
 
 		 506 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36 
 
 		 1305 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 261 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44203  predicted protein  43.06 
 
 		 658 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  46.15 
 
 		 472 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>