More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5598 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  37.62 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  33.95 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  32.85 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 230 aa  92  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.49 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.49 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>