More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5594 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  66.04 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  66.04 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  64.8 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  57.41 
 
 		 354 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  38.82 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5129  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  33.19 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  29.02 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.01 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  29.23 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 326 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.84 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  27.59 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.69 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.32 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  31 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 351 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  29.45 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  33.2 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 361 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>