More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5491 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 355 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  69.94 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  68.99 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  65.2 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  55.35 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  56.92 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  59.55 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  58.23 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  59.24 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  58.77 
 
 		 354 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  58.15 
 
 		 372 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  57.83 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  60.83 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  59.55 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  44.85 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  41.61 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  42.71 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  49.1 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  41.21 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  41.48 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  44.14 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  38.06 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  45.57 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  42.06 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  36.98 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  43.58 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  43.78 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37.42 
 
 		 327 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  39.58 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.2 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  36.19 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  37.41 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.14 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  37.14 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  39.19 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.7 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  40.39 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.51 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  26.96 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  26.39 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.55 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  34.47 
 
 		 234 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 		 435 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  29.74 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  28.71 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  33.66 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.14 
 
 		 524 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.52 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 520 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  27.21 
 
 		 524 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 		 513 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.08 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  28.83 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  25.94 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  27.21 
 
 		 521 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  25.84 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 291 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>