224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5462 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
718 aa  1437    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  67.47 
 
 
707 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  66.8 
 
 
710 aa  910    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  68.61 
 
 
700 aa  954    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  67.19 
 
 
707 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  65.98 
 
 
710 aa  886    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  67.04 
 
 
713 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  67.19 
 
 
707 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  67.56 
 
 
719 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  68.85 
 
 
700 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  46.21 
 
 
687 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  49.61 
 
 
695 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  49.69 
 
 
695 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  49.06 
 
 
695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  48.91 
 
 
695 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  46.57 
 
 
688 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  46.14 
 
 
695 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  46.31 
 
 
659 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  44.65 
 
 
687 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  41.91 
 
 
691 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  40.92 
 
 
682 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.21 
 
 
679 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.1 
 
 
680 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.47 
 
 
698 aa  361  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  33.66 
 
 
697 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  36.27 
 
 
693 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  36.95 
 
 
679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.29 
 
 
692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  33.24 
 
 
681 aa  326  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  34.75 
 
 
680 aa  326  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  35.94 
 
 
690 aa  326  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  35.61 
 
 
670 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  36.53 
 
 
672 aa  317  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.57 
 
 
688 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.59 
 
 
697 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  34.68 
 
 
702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.57 
 
 
713 aa  272  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  32.92 
 
 
704 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  30.27 
 
 
716 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  51.65 
 
 
625 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  29.1 
 
 
749 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.41 
 
 
653 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.95 
 
 
699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.67 
 
 
664 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.84 
 
 
664 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  34.31 
 
 
639 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.39 
 
 
730 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 
725 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 
725 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  26.34 
 
 
736 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.94 
 
 
724 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  26.88 
 
 
725 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  24.96 
 
 
691 aa  132  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  25.61 
 
 
724 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  26.2 
 
 
725 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.2 
 
 
725 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  25.9 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.48 
 
 
739 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  26.47 
 
 
744 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.88 
 
 
733 aa  127  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.06 
 
 
676 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.79 
 
 
733 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.38 
 
 
731 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.05 
 
 
670 aa  124  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.59 
 
 
722 aa  123  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  28.08 
 
 
734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.19 
 
 
733 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  27.83 
 
 
732 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  27.12 
 
 
733 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  28.72 
 
 
676 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
734 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
734 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.46 
 
 
673 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.46 
 
 
673 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 
733 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  26.34 
 
 
734 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.46 
 
 
673 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 
727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  26.17 
 
 
727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  23.86 
 
 
711 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.51 
 
 
727 aa  118  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  25.27 
 
 
662 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.84 
 
 
662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  26.26 
 
 
727 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.42 
 
 
726 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  23.59 
 
 
728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.75 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.29 
 
 
662 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  26.27 
 
 
727 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  25.66 
 
 
726 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  25 
 
 
731 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  30.2 
 
 
726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  36.46 
 
 
726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  25.2 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>