89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5397 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  62.23 
 
 
185 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  74.51 
 
 
185 aa  220  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  74.51 
 
 
185 aa  220  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  74.51 
 
 
185 aa  220  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  61.93 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  73.86 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  73.86 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  73.86 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  73.86 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  75.16 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  65.82 
 
 
185 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  69.54 
 
 
185 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  70.2 
 
 
185 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  70.2 
 
 
185 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  57.46 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  56.63 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  66.67 
 
 
180 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  58.21 
 
 
214 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  56.43 
 
 
212 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  52.94 
 
 
212 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  53.95 
 
 
214 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  44.67 
 
 
179 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  44 
 
 
179 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  43.24 
 
 
179 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  43.24 
 
 
182 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  38.95 
 
 
182 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  45.14 
 
 
179 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  42 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  43.33 
 
 
179 aa  131  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  43.33 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  41.33 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  87.8  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  37.98 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.5 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  31.5 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  34.11 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  29.32 
 
 
137 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  34.17 
 
 
142 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.23 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  31.53 
 
 
146 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  37.66 
 
 
131 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  31.01 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  32.26 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  29.76 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 
204 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  28 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  31.3 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.27 
 
 
316 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  37.18 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  29.51 
 
 
132 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  33.75 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  25.56 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  29.75 
 
 
132 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  30.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  30.09 
 
 
144 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 
138 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  35.9 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  35.9 
 
 
123 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  36.99 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  34.57 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  23.6 
 
 
284 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  34.21 
 
 
157 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  24 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  26.15 
 
 
145 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  28.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  29.66 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  28.97 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  28.12 
 
 
141 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  32.79 
 
 
85 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  29.93 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.49 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.49 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  45.65 
 
 
319 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  31.52 
 
 
126 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  21.09 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  28.22 
 
 
172 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  29.2 
 
 
153 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  37.8 
 
 
139 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  32.88 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>