More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5391 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  59.88 
 
 
804 aa  852    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 
762 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  55.42 
 
 
764 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  72.13 
 
 
864 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  52.96 
 
 
793 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  72.13 
 
 
864 aa  829    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  53.79 
 
 
789 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  56.83 
 
 
763 aa  760    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  65.89 
 
 
769 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  72.81 
 
 
1079 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.59 
 
 
764 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  65.41 
 
 
769 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  65.4 
 
 
769 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 
755 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 
767 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  72.13 
 
 
864 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  71.79 
 
 
832 aa  832    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 
765 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  54.81 
 
 
768 aa  767    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  67.06 
 
 
766 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  65.89 
 
 
769 aa  906    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  68.94 
 
 
864 aa  830    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  65.67 
 
 
769 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  54.99 
 
 
769 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  65.89 
 
 
769 aa  906    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  72.13 
 
 
864 aa  829    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  68.94 
 
 
864 aa  831    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
760 aa  1489    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
808 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  46.68 
 
 
752 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 
896 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 
896 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.25 
 
 
734 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
742 aa  361  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
762 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
741 aa  356  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
679 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
679 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
686 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
740 aa  347  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.37 
 
 
878 aa  334  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
784 aa  326  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.36 
 
 
764 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.79 
 
 
769 aa  319  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.77 
 
 
1992 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.66 
 
 
769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.83 
 
 
769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
777 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
2539 aa  311  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 
1987 aa  310  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.19 
 
 
770 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
783 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
781 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.53 
 
 
770 aa  303  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
2212 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
756 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
758 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
706 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
705 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.94 
 
 
2301 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  37.98 
 
 
839 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.3 
 
 
1971 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.56 
 
 
1866 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
660 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
598 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.52 
 
 
774 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.4 
 
 
2476 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  29.75 
 
 
601 aa  283  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
604 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.4 
 
 
2458 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
705 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
1725 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.62 
 
 
2301 aa  280  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
753 aa  280  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
865 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
865 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
1725 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
756 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
2423 aa  278  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
777 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
1609 aa  277  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.46 
 
 
2284 aa  276  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
666 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
750 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.55 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
801 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.32 
 
 
783 aa  273  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
1127 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
1012 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
1629 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.54 
 
 
1834 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1646 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1646 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27.36 
 
 
798 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
1758 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
681 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
1065 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1647 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
1907 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  29.28 
 
 
598 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>