38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5290 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  51.09 
 
 		 980 aa  942    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  42.61 
 
 		 942 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  41.08 
 
 		 919 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  43.08 
 
 		 948 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  41.22 
 
 		 943 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  100 
 
 		 961 aa  1981    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  43.31 
 
 		 941 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  44.08 
 
 		 970 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  51.68 
 
 		 953 aa  913    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  44.1 
 
 		 923 aa  737    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  41.64 
 
 		 925 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  51.43 
 
 		 948 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  41.31 
 
 		 918 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  38.93 
 
 		 917 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  40.04 
 
 		 922 aa  605  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  35.61 
 
 		 939 aa  561  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  33.77 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  36.53 
 
 		 948 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  36.11 
 
 		 933 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  32.66 
 
 		 917 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  39.9 
 
 		 985 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  62.18 
 
 		 305 aa  347  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  53.29 
 
 		 321 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1002 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  26.81 
 
 		 795 aa  221  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  40.41 
 
 		 262 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  29.32 
 
 		 282 aa  105  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  32.25 
 
 		 286 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  23.24 
 
 		 764 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  24.03 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  30.22 
 
 		 262 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  29.33 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  26.07 
 
 		 258 aa  57.4  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  25.45 
 
 		 253 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  22.77 
 
 		 272 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  22.32 
 
 		 272 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 286 aa  44.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>