37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5258 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  64.41 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  31.77 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  30.82 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.6 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  33.83 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  24.73 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  25.56 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  30.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  29.9 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  32.64 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  34.88 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  32 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.84 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  27.5 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  27.5 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.89 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  27.5 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  26.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.65 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  26.03 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.92 
 
 		 241 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>