More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5244 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
318 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3810  putative glycosyl transferase, group 1  65.94 
 
 
330 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4887  glycosyl transferase, group 1  65.94 
 
 
330 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0758774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4382  glycosyl transferase, group 1  66.13 
 
 
315 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3037  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.22 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1384  glycosyltransferase  62.22 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3166  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.54 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5445  glycosyl transferase group 1  62.22 
 
 
316 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6395  glycosyl transferase group 1  61.9 
 
 
316 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231672  normal  0.0895127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5647  glycosyl transferase, group 1  61.9 
 
 
316 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6041  glycosyl transferase group 1  61.9 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196578  normal  0.930555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1380  glycosyl transferase, group 1  61.59 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6449  glycosyl transferase, group 1  61.59 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0743  glycosyltransferase  59.81 
 
 
330 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1782  glycosyltransferase  56.19 
 
 
329 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3726  glycosyl transferase group 1  55.31 
 
 
465 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5046  glycosyltransferase  53.14 
 
 
347 aa  329  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0121544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5592  glycosyl transferase group 1  50.65 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.569837 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1008  glycosyltransferase  63 
 
 
233 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.371268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1296  hypothetical protein  63 
 
 
233 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.213453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0150  glycosyl transferase group 1  45.05 
 
 
314 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  45.86 
 
 
328 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0714  glycosyl transferase, group 1  42.54 
 
 
315 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0520685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2456  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 
319 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652832  normal  0.243441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11340  glycosyltransferase  38.14 
 
 
314 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.852115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0354  transferase  35.58 
 
 
338 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2646  group 1 glycosyl transferase  37.38 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0458  transferase  36.39 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.425335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1572  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999019  normal  0.0163981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1761  hypothetical protein  35.83 
 
 
325 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1747  hypothetical protein  35.83 
 
 
325 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0568  transferase  33.95 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1295  putative transferase  55.56 
 
 
81 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1007  glycosyltransferase  55.56 
 
 
81 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  27.03 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 
406 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
414 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
414 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0258  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 
381 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
392 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
405 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
381 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
380 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
420 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
360 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.27 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
367 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
406 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
414 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  32.71 
 
 
397 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
390 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
410 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
366 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
387 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
355 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
366 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>