More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5139 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  100 
 
 
394 aa  772    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  81.56 
 
 
392 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  81.04 
 
 
392 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  79.24 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  78.63 
 
 
396 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  78.63 
 
 
396 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  78.37 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  75.45 
 
 
397 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  75.92 
 
 
390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  77.35 
 
 
401 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  75.32 
 
 
401 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  77.93 
 
 
390 aa  544  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  76.7 
 
 
401 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  76.44 
 
 
390 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  73.33 
 
 
390 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  73.33 
 
 
390 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  72.56 
 
 
390 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.13 
 
 
400 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  65.45 
 
 
385 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  65.82 
 
 
399 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  64.48 
 
 
398 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.95 
 
 
395 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  62.17 
 
 
393 aa  454  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.88 
 
 
382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.29 
 
 
392 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  79.03 
 
 
188 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  79.03 
 
 
188 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  81.62 
 
 
187 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  81.62 
 
 
187 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  35.37 
 
 
383 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.92 
 
 
393 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.15 
 
 
379 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.47 
 
 
382 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  33.74 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.05 
 
 
387 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.1 
 
 
404 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.55 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  31.71 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  36.04 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.07 
 
 
376 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.71 
 
 
453 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.59 
 
 
393 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.77 
 
 
386 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  30.52 
 
 
446 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.56 
 
 
442 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.6 
 
 
456 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.03 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.73 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  29.15 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  30.41 
 
 
456 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.71 
 
 
455 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  30.91 
 
 
450 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.92 
 
 
456 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.35 
 
 
445 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.66 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.96 
 
 
443 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  29.24 
 
 
450 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  29.04 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  29.41 
 
 
456 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  30.58 
 
 
428 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.13 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.72 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.1 
 
 
428 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.42 
 
 
418 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.8 
 
 
420 aa  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.85 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.43 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  30.52 
 
 
454 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.38 
 
 
416 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  29.79 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.7 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  26.65 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  29.38 
 
 
463 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.73 
 
 
352 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  26.48 
 
 
466 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  32.17 
 
 
417 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  29.21 
 
 
451 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.64 
 
 
441 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  29.13 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.3 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  25.43 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.5 
 
 
467 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  27.03 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  25.75 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  26.15 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  27.72 
 
 
467 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  25.93 
 
 
408 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.72 
 
 
471 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  29.02 
 
 
397 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.33 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  25.87 
 
 
469 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.86 
 
 
469 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.88 
 
 
469 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.79 
 
 
469 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  29.46 
 
 
450 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  26.32 
 
 
462 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  28.74 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  27.12 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
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NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  25.92 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
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