207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5113 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  49.61 
 
 		 1150 aa  1098    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.91 
 
 		 1150 aa  1074    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  67.13 
 
 		 1152 aa  1553    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 1132 aa  2339    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  65.57 
 
 		 1152 aa  1531    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 1146 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 889 aa  221  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.16 
 
 		 572 aa  201  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.52 
 
 		 786 aa  183  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  29.21 
 
 		 533 aa  179  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.78 
 
 		 554 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.15 
 
 		 543 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3188  hypothetical protein  35.34 
 
 		 342 aa  157  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.86 
 
 		 567 aa  148  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.04 
 
 		 569 aa  145  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1253  esterase/lipase  34.25 
 
 		 354 aa  145  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 591 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 591 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 581 aa  141  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  27.35 
 
 		 552 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 591 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  27.68 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  27.35 
 
 		 632 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  27.68 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  27.68 
 
 		 632 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  27.68 
 
 		 653 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  27.68 
 
 		 632 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 567 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 540 aa  139  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 696 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 		 623 aa  136  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  31.37 
 
 		 367 aa  135  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  26.61 
 
 		 578 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 563 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 		 557 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  29.97 
 
 		 364 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 547 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.81 
 
 		 582 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.63 
 
 		 570 aa  125  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.36 
 
 		 543 aa  125  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.69 
 
 		 535 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 		 556 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.63 
 
 		 586 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  27.11 
 
 		 551 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 		 583 aa  114  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  27.95 
 
 		 563 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.32 
 
 		 550 aa  108  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.63 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 556 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 657 aa  102  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 577 aa  101  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  27.68 
 
 		 622 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 		 552 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  25.22 
 
 		 546 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  25.18 
 
 		 544 aa  97.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 564 aa  95.1  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 577 aa  93.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 587 aa  92.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.87 
 
 		 565 aa  92  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  24.96 
 
 		 541 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  25.6 
 
 		 534 aa  89.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  22.63 
 
 		 502 aa  88.2  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  25.04 
 
 		 534 aa  87.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  27.04 
 
 		 530 aa  87  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  28.22 
 
 		 543 aa  87  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  25.78 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  24.22 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 505 aa  84  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.13 
 
 		 546 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.77 
 
 		 537 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.54 
 
 		 711 aa  76.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.26 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.48 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.54 
 
 		 657 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  29.39 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3189  hypothetical protein  29.7 
 
 		 210 aa  72  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00130632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.45 
 
 		 357 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  26.99 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  26.24 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.69 
 
 		 563 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 357 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.45 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.26 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  24.1 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  29.55 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  23.25 
 
 		 533 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.29 
 
 		 539 aa  64.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.74 
 
 		 515 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.26 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.47 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2161  choline dehydrogenase  29 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.96 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.78 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>