More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5088 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  72.27 
 
 		 257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  74.38 
 
 		 257 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 226 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  42.56 
 
 		 225 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  38.5 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  36.36 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  36.49 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  34.07 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36.98 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  34.39 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 240 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.16 
 
 		 224 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  32.84 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 211 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 233 aa  95.5  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>