21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5029 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  36 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  29.75 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  30 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  28 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  32.37 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  32.37 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  30.07 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  28.38 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  31.18 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  27.89 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  26.21 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  22.07 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  25.5 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  26.21 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  26.21 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  23.42 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  22 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  22.82 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  22.78 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>