More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5025 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 
749 aa  1481    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  32.34 
 
 
739 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  31.69 
 
 
734 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  29.77 
 
 
729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  26.51 
 
 
721 aa  257  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  26.31 
 
 
721 aa  257  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  28.45 
 
 
730 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  30.64 
 
 
733 aa  230  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  27.97 
 
 
727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  29.48 
 
 
731 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  26.02 
 
 
1177 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  26.38 
 
 
963 aa  190  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.525688 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  26.3 
 
 
1053 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  28.1 
 
 
736 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  25.2 
 
 
964 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  26.39 
 
 
619 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  23.89 
 
 
955 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  25.04 
 
 
560 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  25.58 
 
 
540 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  26.98 
 
 
703 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  28.51 
 
 
603 aa  95.9  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  27.78 
 
 
747 aa  95.5  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  23.72 
 
 
606 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  27.41 
 
 
730 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1990  sulphate transporter  26 
 
 
518 aa  90.5  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638858  normal  0.0857546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  27.7 
 
 
703 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  28.45 
 
 
599 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  22.41 
 
 
562 aa  85.9  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  24.36 
 
 
549 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  25.41 
 
 
577 aa  85.9  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3208  sulphate transporter  27.01 
 
 
540 aa  85.1  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  21.82 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  23.71 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1617  sulfate permease family protein  24.84 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0125947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  25.94 
 
 
568 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  25.83 
 
 
590 aa  84  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  23.25 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  21.24 
 
 
487 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  25.75 
 
 
568 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  22.22 
 
 
556 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1261  sulphate transporter  26.95 
 
 
515 aa  83.2  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  26.45 
 
 
711 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  24.91 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  27.87 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  23.7 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  24.51 
 
 
552 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1749  sulphate transporter  24.74 
 
 
519 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000311132  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2658  sulphate transporter  24.74 
 
 
519 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000674443  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  23.49 
 
 
499 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1709  sulphate transporter  24.74 
 
 
519 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000377165  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  24.48 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  25.39 
 
 
568 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  21.43 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1533  sulphate transporter  22.69 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  24.1 
 
 
549 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1231  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 
521 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  23.27 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  24.1 
 
 
549 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  25.5 
 
 
552 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  21.98 
 
 
560 aa  79.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  26.86 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  25.09 
 
 
575 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1706  sulphate transporter  24.95 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000026912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  23.89 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  24.48 
 
 
559 aa  78.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  24.56 
 
 
552 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  25.2 
 
 
565 aa  78.2  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  24.1 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  22.44 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  24.49 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  23.76 
 
 
572 aa  77.8  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4141  sulfate permease family protein  24.95 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.284646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  25.95 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  26.82 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  22.52 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  24.17 
 
 
495 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  25.28 
 
 
573 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  23.51 
 
 
595 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  28.2 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  27.16 
 
 
736 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  26.33 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  26.61 
 
 
632 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  24.04 
 
 
545 aa  75.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03661  Sulfate permease family protein  25.34 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  24.47 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  23.79 
 
 
603 aa  75.1  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  24.21 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  26.86 
 
 
549 aa  74.7  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  24.25 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  24.24 
 
 
592 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42555  predicted protein  20.92 
 
 
1159 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2303  sulphate transporter  24.29 
 
 
519 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  29.32 
 
 
495 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  28.02 
 
 
563 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  25.09 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  22.38 
 
 
563 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  22.22 
 
 
729 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  25.5 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  22.17 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  23.31 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>