More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5022 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  100 
 
 
353 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  61.93 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  59.09 
 
 
351 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  58 
 
 
353 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  57.71 
 
 
353 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  59.21 
 
 
351 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  59.21 
 
 
351 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  58.24 
 
 
351 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  57.88 
 
 
360 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  52.27 
 
 
351 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  54.73 
 
 
360 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  56.73 
 
 
348 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  57.02 
 
 
348 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  56.73 
 
 
348 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  56.45 
 
 
348 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  55.87 
 
 
357 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  51 
 
 
348 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  52.56 
 
 
357 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  53.12 
 
 
351 aa  359  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  51.14 
 
 
349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  49.86 
 
 
358 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  50.28 
 
 
353 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  49.57 
 
 
350 aa  349  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  50.14 
 
 
348 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  51 
 
 
357 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  49.71 
 
 
359 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  47.08 
 
 
343 aa  308  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  38.92 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  38.02 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  35.31 
 
 
341 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.27 
 
 
344 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
363 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
360 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
360 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.1 
 
 
369 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
363 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
355 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
355 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
355 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
355 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 
380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
360 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.13 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  30.12 
 
 
353 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  30 
 
 
360 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
356 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.69 
 
 
416 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  28.92 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
366 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
362 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  62.79 
 
 
140 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.56 
 
 
280 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  32 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  32 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  26.71 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.45 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
226 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 
271 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.41 
 
 
287 aa  56.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
270 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
346 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
439 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 
259 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000217887  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.15 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  29.06 
 
 
184 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
229 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  29.51 
 
 
377 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  32 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
287 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
400 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.25 
 
 
212 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
250 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  23.7 
 
 
205 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  30.86 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>