More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4871 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 506 aa  1040    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  46.14 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3431  AMP-dependent synthetase and ligase  47.41 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 557 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 512 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 510 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 521 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 582 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 561 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 561 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 		 561 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 561 aa  325  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 		 561 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.9 
 
 		 514 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 551 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 527 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 521 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.74 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  36.99 
 
 		 515 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.26 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 559 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 518 aa  309  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  35.5 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 544 aa  306  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 520 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 564 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 577 aa  300  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 525 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 511 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 513 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 514 aa  299  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 591 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.65 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 501 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.6 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 577 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 536 aa  296  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  36.23 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  36.23 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 561 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.23 
 
 		 561 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 561 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.75 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 662 aa  293  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 584 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 544 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 511 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>