More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4833 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  40.21 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  29.74 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  28.81 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  29.06 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 444 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 444 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  28.81 
 
 		 436 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.27 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  31.65 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.38 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.53 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  28 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.55 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.35 
 
 		 423 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.2 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.51 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.4 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.87 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.26 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.87 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.33 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.13 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.45 
 
 		 417 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  25.27 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  26.11 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  29.43 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 983 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 984 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  28.27 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>