More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4824 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 188 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 202 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 196 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 189 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 201 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 770 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.46 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  24.73 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.07 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
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NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.11 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.49 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
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