122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4795 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  68.26 
 
 		 332 aa  351  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  54.48 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  43.68 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  45.39 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  48.23 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  45.71 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  44.29 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  39.21 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  37.62 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  30.88 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  32.09 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  31 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.21 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.55 
 
 		 283 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  40.51 
 
 		 273 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.02 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.27 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  30.33 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  31.76 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.99 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  30.3 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  33.2 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  30.18 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  32.26 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  26.24 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.12 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.63 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.65 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  27.03 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  28.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  28.45 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.12 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.79 
 
 		 654 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.22 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  27.17 
 
 		 752 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  30.2 
 
 		 679 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  29.08 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  26.07 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  30.31 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  28.04 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  25.35 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  26.67 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  27.08 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  33.66 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  26.39 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  27.31 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  26.67 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  26.67 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.32 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  30.25 
 
 		 632 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  27.73 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  27.9 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  30.84 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  26.61 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  26.61 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  26.61 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  24.9 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  30.84 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  25.51 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.18 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  25.51 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  25.51 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.83 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  25.65 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  24.24 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.98 
 
 		 675 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  29.36 
 
 		 722 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.07 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  25.63 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  27.7 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  24.29 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  26.46 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  26.42 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  29.45 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 692 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  23.32 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  29.38 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  31.71 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  23.87 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.45 
 
 		 683 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  25.32 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  22.44 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  25.44 
 
 		 686 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  22.44 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  22.53 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  29.8 
 
 		 671 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>